
Le comité syndical (organe délibérant qui définit les actions) est composé de 32 délégués désignés par les communes membres à raison d'un délégué par tranche de 10.000 habitants. Toutes les communes comptent 1 délégué titulaire et un délégué suppléant à l'exception de Quimper qui en compte 7.
Le bureau syndical est composé de 10 membres :
La présidente : Christine Salabert (commune de Quimper),
4 vice-présidents :
5 membres :
Le bureau et le comité syndical se réunissent généralement selon une fréquence de 4 réunions annuelles qui se tiennent indifféremment dans l'une ou l'autre des 26 communes.
La gestion du Sivalodet est assurée par les services de la ville de Quimper et de Quimper Communauté dans le cadre d'une convention. Deux personnes (un ingénieur et un technicien) sont affectées à temps complet au syndicat qui bénéficie par ailleurs de l'appui des différents services de la ville et de la communauté d'agglomération.
Le budget du Sivalodet se monte à près de 400.000 € par an.
Il est d'abord alimenté par des participations communales qui comprennent deux parts : une part fixe par habitant et une part variable calculée au prorata du potentiel fiscal de chaque commune. Les participations communales sont ensuite pondérées en fonction de la surface communale comprise dans le bassin versant .
Le budget est également alimenté par les subventions des différents partenaires financiers du Sivalodet : Agence de l'eau, Conseil régional, Conseil général.